重庆医科大学附属璧山医院病理科创建于1980年，发展至今已是一个集多种病理检查和科研教学功能于一体的综合性科室，现占地面积1000余平方米，设有取材室、常规石蜡制片室、术中冰冻制片室、细胞室、分子室、免疫组化室、病理诊断室等；科室全体医务人员竭力打造“镜下觅踪迹，慧眼辨良善”科室品牌。现承担全院及邻近区域的各种病理检查和疑难病理会诊任务,为璧山区病理质控中心。

科室近5年获省部级课题立项3项、厅局级课题立项3项、院级课题立项4项；先后发表科研论文20余篇，其中SCI论文9篇；2名医师近期曾先后荣获重庆市青年病理医师诊断大赛一等奖；通过多轮次全国或重庆市常规HE染色、免疫组化染色、EGFR基因检测等室间质控。

科室常规开展快速石蜡病理诊断、常规石蜡病理检查与诊断、各种脱落细胞学（含细胞蜡块）检查与诊断、术中冰冻检查与诊断、免疫组化及特殊染色技术（含免疫荧光）、原位杂交技术、肿瘤靶向基因和分子病理检测等。

科室各实验室均配备具有国际先进水平的仪器设备，包括：德国进口冰冻切片机Leica CM1950,德国进口全自动病理组织脱水机Leica ASP300S，德国进口病理组织切片机Leica RM2235及2135、德国进口显微镜Leica DM2000，日本进口显微镜Olympus CX21、CH30、BX51及BX53等；分子病理实验室配备有美国进口ABI7500荧光定量PCR仪、化学发光免疫分析仪、E6150荧光定量仪等先进设备。